Yo colecciono series y usualmente no tiempo de verlo en casa así que las paso a mi ipod para verlas mientras viajo. Fue cuando ahi cuando empece a investigar acerca de la transcodificación.
Transcodificar quiere decir, codificar algo codificado en un formato a otro. Es como traducir de alemán al hebreo. Pero en este caso lo que se hace es decodificar un video y el resultado volverlo a codificar en otro formato.
El mejor software para hacer esto (según mi opinion) es MediaCoder debido a que es libre y me da la posibilidad de modificar muchas variables. Lamentablemente solo esta diseñado para correr sore Windows pero puedes usarlo sobre Linux usando Wine.
Y el mejor formato para codificar un vídeo, bueno, eso depende de que uso le vayamos a dar. Si lo que deseas es usarlo en tu ipod/reproductor mp3/telefono móvil (3G) o publicarlo en internet la mejor elección sería hacerlo en mp4. MP4 es un formato contenedor que abarca muchos codecs entre ellos el h264 para video y el aac para audio. Un formato contenedor es tan solo un conjunto de estandares para la codificación de datos.
El h264 es uno de los mejores codecs de video del mercado debido a que ofrece una buena calidad de imagen usando menos espacio. Ademas tanto como Apple como Adobe Flash soportan este formato en sus productos. (Ademas de otras empresas para sus telefonos o reproductores de video). Para el audio tenemos el codec AAC que viene de las siglas Advanced Audio Coding (¿falta de creatividad?) a como el h264 para video ofrece tambien una alta taza de compresión sin mayor perdida de calidad lo que lo hace ideal para su uso en internet.
Los dos codecs pertenecen al estandar MPEG-4 lo que nos permite usarlos simultaneamente en el mismo archivo.
Los parámetros correctos para codificar un vídeo en mp4 pueden ser largos y variados, dependiendo de para que vayamos a usar el resultado. En esto nos ayuda MediaCoder ya que de forma grafica podemos configurar estos valores y guardarlos para su posterior re-uso.

Transcodificando un archivo
El programa en si, nos ofrece muchas opciones, tantas que intimda al usuario comun. Pero ademas, tambien incluye lo que llama “Extensiones” que son asistentes que le ayudan a elegir el formato final dependiendo de cual sea el equipo donde desea reproducir el video. Estos asistentes muestran una vista mucho mas simple y amigable al usuario ayudandolo en su busqueda de lograr el resultado que desea.
Pero no siempre es bueno confiar ciegamente en los asistentes. No es mala idea documentarse en al menos los principios basicos sobre codificación de video. Es un tema muy interesante. Personalmente, yo me quede justo ahi y me detuve justo cuando el tema empezo a hacerse complicado.

Usando uno de los asistentes de MediaCoder
Lo mas probable es que lo que desees sea convertir videos a un formato que te brinde una buena calidad al menor tamaño. En ese caso mp4 es una excelente opcion debido a que es ya casi un estandar en internet y en dispositivos móviles. En el siguiente enlace puedes descargar la configuracion preestablecida para MediaCoder (Menu Archivo/Cargar Configuracion Preestablecida) para crear archivos mp4 usando la siguiente configuracion:
- Formato Contenedor: MP4
- Codec de Video: H.264
- Perfil: Baseline 3.0 (este es el perfil mas compatible)
- Bitraje: 450kbps (aumentar para mejorar la calidad, pero tambien aumenta el tamaño del video)
- Modo: 2 pasadas (a mas pasadas mejor, 2 es lo recomendado)
- Imagenes por segundo: 25fps (lo normal es usar entre 24 a 30, nunca menos)
- Audio: AAC
- Bitraje: 56kbps
- Parametric Stereo: Si
Descargar Preset para transcodificar videos a mp4 con MediaCoder
Con esta configuración el video resultante puede reproducirse en un ipod Touch y por Adobe Flash Player (este es el formato que usan YouTube, Vimeo, Dailymotion).
Estos son algunos enlaces que te pueden servir:
Descarga de MediaCoder (actualmente en su version 0.7)
En Wikipedia: MPEG-4, H.264, AAC, transcodificar.
K-Lite Codec Pack. De que otra manera veras el resultado antes de copiarlo a su destino final si es que tu pc no tiene lo necesario para reproducir archivos mp4. K-Lite Codec Pack instala en tu pc los codecs usados en este tutorial y muchos mas.
Gom Player. Bonito, bueno y barato. Este reproductor tiene muchas opciones y reproduce muchos formatos (incluyendo FLV, MOV y MP4).